Istnieje schronienie dla uchodźców z Gotham — dopóki Pingwin nie przybywa po swoich ludzi. Zdeterminowana Selina prosi Bruce’a o pomoc w szukaniu Jeremiaha.
Siły specjalnie przyjeżdżają do Gotham, aby zaprowadzić porządek. Poszukiwania odpowiedzi doprowadzają Nygmę do Pingwina — i do ponownego spotkania z Hugo Strange’em.
Gdy Gordon zbiera zespół, aby odbić Gotham, na wojnie o miasto zawiązują się niespodziewane sojusze. Przebiegły nowy złoczyńca narusza spokój Pingwina i Seliny.
Gordon walczy z czasem, starając się ujawnić kryminalistów, którzy zagrażają zjednoczeniu Gotham. Znajomy złoczyńca powraca z pomocą Szalonego Kapelusznika.
Bane i Nyssa umacniają swoje panowanie w mieście, a Gordon zwraca się do byłych wrogów o pomoc, aby je ocalić. Poważna decyzja zwraca Bruce’a ku jego przeznaczeniu.
Dziesięć lat po opuszczeniu Gotham Bruce powraca do miasta na otwarcie nowego wieżowca Wayne’a i odkrywa, że mroczne miasto potrzebuje swojego rycerza.