Dwa lata po pokonaniu Susano-oh w San Francisco pojawiają się Aragami a zespół TAC musi zjednoczyć się ponownie by je powstrzymać. Jak się okazuje są one dziełem szalonego naukowca, który chce zniszczyć ludzkość. Tym razem pomaga im amerykańskie wojsko i dysponująca mocą mitamy Valencia Tachibana. Chwilę później TAC, wpada w pułapkę chciwego terrorysty.