Kiedy Jenny wraca z wycieczki po Europie, cała ekipa NCIS zostaje poddana badaniu wykrywaczem kłamstw przez Wydział Bezpieczeństwa Wewnętrznego. Najgłębiej skrywane sekrety każdego z agentów mogą zostać ujawnione.
Kiedy dyrektorka Jenny Shepard wyjeżdża z miasta na prowincję, Gibbs przejmuje jej obowiązki. Mimo szczerych chęci ciężko jest mu grać powierzoną rolę, toteż ciągle kieruje pracą jego zespołu wyjaśniając zagadkę śmierci człowieka, który chciał się z nim spotkać.