„Submarino” to historia dwóch braci, którzy dorastali w biedzie, „wychowywani” przez matkę-alkoholiczkę. Nick ma teraz trzydzieści trzy lata i właśnie wyszedł z więzienia. Jego dni są wypełnione ćwiczeniami fizycznymi i piciem alkoholu. Jego młodszy brat jest narkomanem i samotnym ojcem, dla którego w życiu liczą się tylko dwie rzeczy: kolejna działka i lepsza przyszłość dla jego sześcioletniego syna. Bracia mieszkają w Kopenhadze, ale nie widują się zbyt często, ani nie mają ze sobą wiele wspólnego. Paradoksalnie, ich drogi połączą się w więzieniu, ale czy nie będzie za późno, żeby odnaleźli wspólny język?