Gdy anomalia w siedzibie Johnsona otwiera się ponownie, Sarah i Becker wyruszają, by sprawdzić, co się dzieje. Helen postanawia, że jedynym sposobem na ocalenie życia na Ziemi jest powstrzymanie ewolucji ludzi. Rusza więc w przeszłość, by zabić hominidy, czyli praprzodków człowieka. Ekipa musi powstrzymać Helen za wszelką cenę. Naukowcy przedzierają się więc przez kilka anomalii, walcząc z drapieżnikami z przyszłości i przeszłości. Jeden z członków ekipy spotka się też z praprzodkami człowieka, hominidami.