Do tej pory największymi zmartwieniami Mike'a były lekcje, prace domowe i flirtowanie z dziewczynami. Pewnego dnia, odkrywa, że jest ostatnim spadkobiercą długiej linii wojowników ninja! Mike werbuje do swojej drużyny ninja swego najlepszego przyjaciela - Owena oraz najpopularniejszą w szkole Amandę - blond piękność, która podoba mu się od lat. Razem tworzą zespół "Super Ninja". Nastolatki ćwiczą pod czujnym okiem legendarnego mistrza. Za pomocą hologramu dziadka Mike'a - mistrza ninja, bohaterowie nauczą się sztuk walki. Pomiędzy zajęciami, szkoleniami i bitwami w Empire City, trio nie będzie miało ani chwili odpoczynku!