Akcja dzieje się 6 miesięcy po zakończeniu poprzedniego sezonu Kości. Na świecie jest już syn Bones i Bootha - Hank. Oboje nie pracują już w Instytucie Jeffersonian i FBI. Cam szuka zastępcy na miejsce Brennan, myśli o zatrudnieniu Arastoo. Tymczasem dawny zespół Cam zostaje wezwany do spalonego samochodu, a w nim spopielonych zwłok. Badania, rekonstrukcja twarzy oraz numer broni wskazują co bardzo dziwi, że jest to Booth. Jedynie Bones nie wierzy, że to jej mąż. Po poszukiwaniach okazuje się, że przeoczono jeden drobiazg, który różnił ciało młodego człowieka od Bootha.