Trzy lata po tajemniczym zniknięciu Batmana, Gotham został opanowany przez gangi. Po zwolnieniu ze szkoły wojskowej i latach morderczego treningu przetrwania, Kate Kane aka Batwoman (Ruby Rose) wraca do Gotham. Tymczasem gang Alice (Rachel Skarsten) zwany "Alice in Wonderland" atakuje ojca Kate, Jacoba Kane'a (Dougray Scott) i jego firmę ochroniarską, oraz porywa najlepszą oficer Crow - Sophie Moore (Meagan Tandy).
Gotham jest poruszone domniemanym romansem Batwoman z przystojnym policjantem. Alice świętuje swój ostateczny akt zemsty. Kate jest rozdarta między dwiema siostrami. Gotham zostało zaatakowane przez hakera.
Batwoman i Luke są na tropie złoczyńcy atakującego ludzi z mediów społecznościowych. Sophie niespodziewanie odwiedza matkę. Mary oferuje swoją wiedzę, aby pomóc Kate. Alice koncentruje się na swoich planach zemsty.
Okazuje się, że Alice jednak żyje i rusza uratować swojego brata. Mysz jest przerażony pojawieniem się siostry. Obezwładnia ją i częstuje toksyną, wyzwalającą najgorsze lęki. Alice czeka spotkanie z królową. Mary i Luke podążają za zabójcą Beth.
Rodzina Kane musi pozbyć się ciała. Kate nie potrafi poradzić sobie z wyrzutami sumienia i zaczyna kwestionować swój instynkt. Luke dostaje niepokojące wieści. Alice szuka pomocy siostry w specjalnym zadaniu.
Życie Batwoman znajduje się w niebezpieczeństwie. Z ratunkiem rusza nieustraszona Mary. Kate zostaje wykorzystana przez swoją byłą dziewczynę, a dziennik, którego wszyscy pragną, wpada w niepowołane ręce.
W mieście pojawia się zamaskowany porywacz. Członkowie inteligencji Gotham zaczynają znikać. Kate zaczyna kwestionować lojalność wszystkich wokół niej.
Mysz pokazuje Alice aplikację mobilną opracowaną z myślą o wysyłaniu alertów do Wron. Batwoman spotyka się z bratem Tima, Apollo, aby go ostrzec. Alice tworzy nową twarz Elliota, która przypomina Bruce'a Wayne'a.