Dr J. Allen Hynek, znakomity astrofizyk, zostaje zwerbowany do ściśle tajnego programu prowadzonego przez kapitana Michaela Quinna. Powoli zaczyna zdawać sobie sprawę, w czym naprawdę bierze udział.
Dr Allen Hynek, astrofizyk z Ohio, zostaje zwerbowany przez amerykańskie lotnictwo. Ma zbadać historię pilota, który przeżył walkę powietrzną z pozaziemskim statkiem latającym.
Dr Hynek i kapitan Quinn badają sprawę z Wirginii Zachodniej. Kobieta z dwójką dzieci widziała katastrofę latającego spodka niedaleko farmy. Twierdzą oni, że z płonącego wraku wydostał się kosmita.
Spotkanie pasażerskiego samolotu z UFO naprowadza Hynka i Quinna na trop tajnego programu, nad którym pracują między innymi dawni nazistowscy naukowcy. Chodzi o Operację "Paperclip".
Hynek i Quinn jadą do Roswell w Nowym Meksyku za generałem Hardingiem. Anonimowy mieszkaniec miasta grozi, że pokaże światu dowody na katastrofę UFO sprzed sześciu lat.
Hynek i Quinn badają sprawę żołnierza, który na terenie pustynnej bazy wojskowej został uprowadzony przez UFO. Szybko orientują się, że Strefa 51 ma powody, aby zazdrośnie strzec swych tajemnic…
Kiedy w domu w stanie Kentucky zjawiają się istoty pozaziemskie, Hynek i Quinn trafiają na MK Ultra — supertajny program CIA, według którego ten atak może być początkiem inwazji na większą skalę.
Na planie filmu „Bliskie spotkania trzeciego stopnia" Hynek wspomina swoje doświadczenia z niesławnym panelem Robertsona i spotkanie z osobą, która przeżyła spotkanie z kosmitami.
Dwóm generałom skradziono bardzo ważne materiały. Hynek i Quinn zdają sobie sprawę, że niepodważalny dowód na istnienie UFO jest bliżej niż mogli sobie wyobrazić.
Kiedy Hynek i Quinn namierzają samolot, który zaginął w Kanadzie, wyruszają na misję, aby odzyskać jego zaginiony ładunek, stanowiący zagrożenie nie tylko dla ich Projektu, ale dla całego świata.
Kiedy niezidentyfikowane obiekty latające i pływające pojawiają się w pobliżu rosyjskich wód, gdzie prowadzone są duże manewry morskie, Hynek i Quinn muszą zapobiec wybuchowi III wojny światowej.