Utopia to thriller spiskowy przedstawiający losy młodych fanów trudnego do zdobycia komiksu o tym samym tytule. Zawarty w nim spisek okazuje się istnieć naprawdę, a przepowiadana zagłada oraz koniec świata, jaki znamy, zmusza grupkę nerdów do rozpoczęcia pełnej zwrotów akcji gry o wysoką stawkę. Poznane informacje wykorzystują, by ratować siebie, przyjaciół, a ostatecznie naszą cywilizację.
Gdy pojawia się wyczekiwany komiks, grupka fanów nie może się doczekać, by dostać go w swoje ręce, nieświadomie wystawiając się na śmiertelne niebezpieczeństwo.
Młodzi fani komiksu dokonują ważnego odkrycia i wkrótce zostają wciągnięci w niebezpieczny świat Jessiki Hyde. Tymczasem dwóch naukowców o bardzo różnych ścieżkach kariery styka się ze śmiertelną grypą.
Jessica musi pogodzić się ze wstrząsającą informacją, podczas gdy Arby kwestionuje swoją przeszłość. Poszukiwanie odpowiedzi negatywie odbija się na Michaelu.
Wskazówka w Utopii doprowadza Jessicę wraz z ekipą do tajemniczego nowego sprzymierzeńca. Thomas obmyśla oryginalny sposób na poradzenie sobie z Michaelem, a Christie podejmuje decyzję.
W gorącej strefie w St. Louis Michael musi dokonać śmiertelnie poważnego wyboru. Sytuacja staje się coraz bardziej niebezpieczna, a Jessica staje twarzą w twarz z kimś ze swojej przeszłości.
Jessica musi pogodzić się ze wstrząsającą informacją, podczas gdy Arby kwestionuje swoją przeszłość. Poszukiwanie odpowiedzi negatywie odbija się na Michaelu.
W ostatnim odcinku tego sezonu świat niecierpliwie wyczekuje wyprodukowanej przez doktora Christie szczepionki, a Jessica wraz z ekipą spieszą się, by zapobiec Zagładzie.