W roku 2292 na Ziemię przybywa biomechaniczny pancerz zwany Orgun, będący dezerterem z armii podobnych sobie istot, które przemierzają wszechświat, niszcząc wszystko na swojej drodze. Połączony z nastolatkiem Tomoru Shindo musi powstrzymać inwazję, w czym pomagają im ziemskie siły obronne.
Znudzony swoim życiem Tomoru Shindo spędza większość czasu w wirtualnej rzeczywistości. Wszystko zmienia się, gdy do Ziemi dociera Mechaniczna istota zwana Orgun, będąca dezerterem z armii Evoluder. Gdy Orgun leczy swoje rany, na Ziemię przybywa kolejny mech mający go zniszczyć.
Rozdarty wewnętrznie po zjednoczeniu z Orgunem Tomoru nie chce ponownego połączenia. W tym samym czasie na Ziemię przybywa kolejny wojownik zwany Rang, a Michi Kanzaki odkrywa, kim są Evoluderzy.