Shinichi przybywa do Tokio, gdzie jeden z 13 naukowców wypuścił zabójczego wirusa, który zabił wszystko w mieście. Dzięki niemu udaje mu się namierzyć kolejnych genetyków i stojącego na ich czele ojca, eksperymentującego na porwanej Marii. By ją ocalić i dokonać zemsty po raz kolejny przyjdzie mu zmierzyć się niepokonanym rodzicem.