Film jest bezpośrednią kontynuacją części pierwszej. Wykonawszy zadanie oddział ośmiu komandosów zbiera się do odlotu. Niestety okazuje się, że szczepionka nie zadziałała, a oni są zarażeni nieznanym wirusem. Trzymając się wojskowych procedur wprowadzają w życie tytułowy Paragraf 78, nakazujący zniszczyć bazę i wyeliminować wszystkich zarażonych. Od tej chwili, nie chcąc zmienić się w bezmyślne stwory, członkowie oddziału zaczynają ze sobą walczyć.