Nastolatek prosi Waltera Shermana o pomoc w odnalezieniu swojego ojca, który zaginął podczas lotu w dzikiej części Florydy. W międzyczasie Leo pomaga zadomowić się w swoim barze małoletniej przestępczyni, która właśnie została zwolniona z aresztu. Walter stara się odzyskać skradzioną gitarę muzyka z Creedence Clearwater Revival.

Walter pomaga byłemu strażnikowi więziennemu odszukać pocisk, który może ocalić życie więźniowi skazanemu na śmierć. W tym samym czasie psycholog z FBI, Lance Sweets, zaczyna doceniać zdolności Waltera, gdy ten zostaje poproszony o pomoc przy rozwiązaniu spraw federalnych. Willa natomiast wpada w tarapaty podczas imprezy na plaży.

Naukowiec z NASA prosi Waltera o pomoc w odnalezieniu buta. Okazuje się, że mężczyzna szuka poznanej w barze kobiety, która zostawiła tam jedną czerwoną szpilkę. Walter używa buta na obcasie jako pierwszej wskazówki podczas poszukiwań zaginionej kobiety. Z czasem okazuje się, że odkrycie zaskakującego sekretu sprowadza na niego niebezpieczeństwo. Tymczasem Willa odkrywa mroczną tajemnicę rodziny Leo, ale kiedy próbuje załagodzić sprawę, pakuje się w jeszcze gorsze kłopoty.

Nowy chłopak Isabel, Frank, gwiazda baseballu, zostaje okradziony. Walt podejmuje odpowiednie kroki, aby odnaleźć wyniesione kolekcjonerskie przedmioty. Podczas śledztwa okazuje się, że Frank stracił coś o wiele bardziej istotnego niż pamiątki. W celu zdobycia zaufania Willi, Leo i Walter postanawiają włączyć ją do sprawy.

Kiedy nowe utwory muzyczne nieżyjącego rapera J-Stryke’a, zostają nielegalnie opublikowane, prawnik muzyka zwraca się do Waltera z prośbą, aby ten wytropił źródło przecieku. W działaniach pomaga Willa, wykorzystując swoje zdolności hakerskie. Walt zbiera wszystkie poszlaki i dochodzi do wniosku, że wie co doprowadziło do śmierci J-Stryke'a.

Naukowiec Jeffersonian Institute, dr Jack Hodgins, wciąga Waltera w poszukiwania statku kosmicznego obcych, który był widziany i został nagrany na taśmie wideo przez pilota powracającego wahadłowca. Pilot ten zginął za to, że nie umiał siedzieć cicho, natomiast drugi pilot, pułkownik Bradshaw został zdyskredytowany przez tajną agencję rządową. Jednak nie wszystko jest takie jakim się wydaje, a życie Waltera, jego rodziny i przyjaciół narażone jest na niebezpieczeństwo i groźby ze strony kobiety o kryptonimie Pope. Willa i Timo starają się rozwiązać swoje małżeństwo z pomocą wujka Shada.

Florydę nawiedza huragan Catherine. Do baru przyjeżdża kuratorka Willi, żeby sprawdzić sytuację mieszkaniową dziewczyny. Zmieniające się warunki pogodowe zmuszają ją jednak do pozostania na miejscu. Walter zabija deskami okna baru i w spokoju przygotowuje się do nadchodzącej burzy. Przygotowuje nawet punch i zaprasza Isabel. Jego przygotowania przerywa wiadomość w telewizji o zaginionej dziewczynie. Huragan zmusza Waltera do odnalezienia jej bez wychodzenia na zewnątrz.

Gdy zostają nielegalnie wydane nowe utwory zmarłego rappera J-Stryke’a, jego prawniczka i była ukochana Leo, szukają pomocy Waltera, żeby dotrzeć do źródła przecieku. Willa służy pomocą swoimi umiejętnościami hakerskimi, ale w miarę jak Walter składa w całość przyczyny śmierci J-Stryke’a, odkrywa o wiele bardziej złożoną historię.

Joe i Annie, kiedyś szczęśliwe małżeństwo, co roku obchodzili swoją rocznicę w restauracji Bella Plata, dopóki mafijny boss Fico Vasquez jej nie zamknął. Teraz, aby ratować swoje małżeństwo Joe prosi Waltera, żeby pomógł mu odnaleźć danie, przy którym on i jego żona się w sobie zakochali. Muszą tym samym namierzyć szefa kuchni restauracji, którego również poszukuje mafia. Tymczasem Willa trafia ponownie do więzienia za wdanie się w bójkę z dziewczyną, która ją udawała.

Kiedy pewna rodzina zatrudnia Waltera do odnalezienia ich zaginionego ojca i męża, jedyną pomocą jaką są w stanie zaoferować jest częściowe nagranie z poczty głosowej jego ostatniej do nich wiadomości. Tymczasem atrakcyjna agentka FBI również szuka tego samego mężczyzny i próbuje zdobyć jak najwięcej informacji na jego temat od Waltera. Wspomnienia Leo o jego zmarłej żonie i córce wnoszą nowe znaczenie do sprawy i rodziny, którą starają się na nowo połączyć.

Joyce, przyjaciółka Isabel, prosi Waltera o odnalezienie człowieka, który zamordował jej ojca, miłośnika wyścigów. Walter odkrywa powiązania ze spadkiem, który Joyce miała odziedziczyć po ojcu z tajemniczymi ludźmi na torze wyścigowym, którzy jak podejrzewa Walter mieli udział w śmierci jej ojca. Tymczasem Willa postanawia, że będzie zdawać do college’u.

Xavier Obispo, szef mafii z Miami, prosi Waltera o odnalezienie laleczki voodoo, która, jak twierdzi, została stworzona w celu użycia przeciw niemu. Willa i nie wierzący w czary Walter odwiedzają wiedźmę, która jest wściekła, że Walter nie traktuje jej umiejętności serio, ale decyduje się im pomóc w odnalezieniu osoby, która mogła stworzyć lalkę, co prowadzi ich do niespodziewanego uczestnika w położeniu szefa mafii. Tymczasem Isabel i detektyw z Miami Curtis Gillespie ryzykują życiem prowadząc śledztwo w sprawie walki gangów podczas pogrzebu związanego z Xavierem.

Pewien ekspert poświadczający autentyczność dzieł sztuki mówi Walterowi i Leo, że komputerowa analiza wcześniej nieznanego dzieła Winslowa Homera, które zostało skradzione i odnalezione przez Waltera cztery lata temu, wykazała, że obraz jest fałszerstwem. Walter zgadza się odnaleźć oryginał. Walter musi również spełnić ostatnie życzenie swojego umierającego ojca.