Emma Swan wie, jak zadbać o siebie. Jednak kiedy Henry, syn, którego lata temu oddała do adopcji ją odnajduje, wszystko zaczyna się zmieniać. Henry uważa, że kobieta pochodzi z alternatywnego świata, ale ona nie wierzy w jego historię. Mimo to Emma postanawia pozostać w Storybrooke i spędzić więcej czasu z synem. Z czasem okazuje się, że w tym miejscu magia została zapomniana, jednak w dalszym ciągu jest wyczuwalna. Bajkowe postacie są wciąż żywe, chociaż wydaje im się, że nie pamiętają, kim byli. Mało kto pamięta, że Zła Królowa, zwana Reginą, jest teraz przybraną matką Henry’ego.

Regina robi wszystko, co w jej mocy, aby zmusić Emmę do opuszczenia Storybrooke. Chce, by kobieta zniknęła z życia jej i syna na zawsze. Zaniepokojona staraniami Reginy Emma postanawia zostać. Tymczasem na jaw wychodzą przerażające okoliczności rzucenia przez Złą Królową klątwy na bajkowy świat. Zła Królowa straciła wszystko przez Śnieżkę i pała żądzą zemsty. Kobieta jest zaślepiona nienawiścią, twierdząc, że nie jest w stanie odzyskać szczęścia.

Naleganie Henry’ego sprawia, że Emma przekonuje Mary Margaret do złożenia wizyty u pogrążonego w śpiączce mężczyzny, którego tożsamości nie ustalono. Henry chce go odwiedzać, aby czytać mu opowieści. Mary Margaret jest zaskoczona efektem wizyty. Tymczasem w świecie baśni Książę spotyka Śnieżkę po raz pierwszy, w dość nieoczekiwanych okolicznościach.

W krainie baśni Kopciuszek zawiera godny pożałowania pakt z Rumpelsztykiem. W świecie rzeczywistym Kopciuszek pracuje jako pokojówka pana Golda. Dziewczyna spodziewa się dziecka i obiecała sprzedać je panu Goldowi. Aby temu zapobiec, do akcji wkraczają Emma i Henry.

Wścibskiemu Henry'emu grozi niebezpieczeństwo, kiedy decyduje się zbadać wnętrze kopalni, aby dowiedzieć się, czy jej korytarze mogą połączyć Storybrooke ze światem baśni. Tymczasem w krainie baśni Jiminy Cricket, najlepszy przyjaciel Geppetta, pragnie opuścić biznes rodzinny, aby przekształcić się w osobę, którą zawsze chciał się stać. W świecie realnym Jiminy jest terapeutą Henry'ego, szantażowanym przez panią burmistrz.

David, znany jako John Doe, musi wybrać pomiędzy pozostaniem z Kathryn lub opuszczeniem jej wraz z Mary Margaret. David jest głęboko i niewytłumaczalnie zakochany w Mary. Emma łapie szeryfa Grahama na kłamstwie. Tymczasem w krainie baśni Książę nosi się z zamiarem uczestniczenia w wydarzeniu, które ma zmienić jego życie i przeznaczenie na zawsze. Zostaje ujawniona tragiczna historia Księcia i jego dzieciństwa.

Jeden z mieszkańców miasta zaczyna przypominać sobie bajkową przeszłość. Storybrooke opłakuje szeryfa Grahama, który zostaje pożegnany przez najbliższych w piękny sposób. W krainie baśni Zła Królowa próbuje odnaleźć bezdusznego zabójcę, aby ten zamordował Śnieżkę. Łowca lituje się nad Śnieżką i w zamian przynosi Królowej serce sarny. Zleceniodawczyni okazuje się sprytniejsza od zabójcy.

Regina wraz z panem Goldem stosują nieczyste polityczne zagrywki. Obierają oni przeciwne stanowiska, kiedy Emma zaczyna starać się o posadę publiczną w Storybrooke. Tymczasem w bajkowym świecie Rumpelsztyk próbuje wyśledzić najwyższe źródło mocy. Niecieszący się dobrą sławą Rumpelsztyk kiedyś uciekł z pola bitwy i ma na sumieniu śmierć setek żołnierzy. Jego żona, nie mogąc znieść hańby, opuściła go lata temu. Jedynym skarbem jest dla niego ukochany syn, który niedługo ma zostać wcielony do królewskiej armii. Rumpelsztyk chce pomóc synowi uniknąć bezsensownej wojny.

Emma stara się pomóc dwóm osieroconym dzieciom. Kobieta dobrze wie, co stanie się, gdy trafią pod kontrolę opieki społecznej, dlatego poszukuje ich biologicznego ojca. Tymczasem w krainie bajek, Jaś i Małgosia zostają porzuceni przez ojca. Pomoc rodzeństwu oferuje Zła Królowa… naturalnie jej oferta nie jest bezinteresowna.

Mary Margaret i David w dalszym ciągu borykają się ze swoją niespełnioną miłością. Regina prosi Emmę, aby ta przyjrzała się obcemu, który pojawił się w mieście. Tymczasem w baśniowym świecie Królewna Śnieżka ma złamane serce, gdy dowiaduje się o ślubie Księcia z córką króla Midasa.

Sydney rekrutuje Emmę do pomocy w poszukiwaniu dowodów, które mogłyby obciążyć Reginę. Mary Margaret i David kontynuują swoje potajemne randki. W tym samym czasie w świecie bajek Król Leopold, ojciec Śnieżki i mąż Złej Królowej, odnajduje magiczną lampę. Dżin, który zamieszkuje przedmiot, obiecuje spełnić trzy życzenia króla, te powinny jednak zostać wypowiedziane bardzo odpowiedzialnie.

Dom pana Golda zostaje obrabowany. Emma obserwuję mężczyznę, gdy nabiera podejrzeń, że ten postanowił odnaleźć kryminalistę na własną rękę. Mary Margaret, Ruby i Ashley spędzają wspólnie babskie walentynki. W krainie baśni Bella musi ratować swoje miasto przed niebezpieczeństwem.

Targany wielkimi emocjami David rozważa wyznanie Kathryn prawdy na temat związku z Mary Margaret, a tym samym zakończenia swojego pozbawionego miłości małżeństwa. Emma umawia się na spotkanie z tajemniczym nieznajomym. Tymczasem w bajkowym świecie Książę, który uciekł ze ślubnego kobierca, poszukuje Królewny Śnieżki.

Leroy zakochuje się w zakonnicy, Astrid, w związku z czym pomaga Mary Margaret sprzedawać świece, z których zysk ma pomóc siostrom utrzymać się w Storybrooke. Emma bada okoliczności nagłego zniknięcia Kathryn. W krainie baśni nowo narodzony krasnoludek, Marzyciel, zakochuje się we wróżce o imieniu Nova.

Emma stara się dociec, czy David zamordował swoją żonę Kathryn. Po tym jak Ruby rzuca pracę, Emma zatrudnia ją w charakterze asystentki, mając nadzieję, że pomoże byłej kelnerce w odkryciu sensu życia. Tymczasem w bajkowym świecie Czerwony Kapturek snuje marzenia o prawdziwej miłości, kiedy wtem pojawia się spragniony krwi, rozszalały wilk.

Mary Margaret zostaje aresztowana za zamordowanie żony Davida. Kobieta wynajmuje pana Golda, aby pomógł jej w obecnej sytuacji. David idzie do doktora Hoppera, aby ten pomógł mu odzyskać utracone wspomnienia. W świecie baśni Królewna Śnieżka zapomina o swojej prawdziwej miłości za sprawą eliksiru Rumpelsztyka. Śnieżka stara się zabić Złą Królową.

Prowadząc poszukiwania zaginionej Mary Margaret, Emma zostaje porwana przez szalonego kapelusznika. Tymczasem Zła Królowa po raz ostatni zleca obdarzonemu wyjątkowymi umiejętnościami człowiekowi wyprawę do krainy baśni, aby wykraść pewien przedmiot od Królowej Kier.

Emma nadal prowadzi wyczerpujące poszukiwania dowodów, które wskażą niewinność Mary Margaret w sprawie zamordowania żony Davida, Kathryn. Tymczasem w dawnej krainie baśni zanim zło opanowało jej duszę, Regina musi dokonać wyboru, czy zdradzić swoją matkę, Corę, i wyjść za mąż z prawdziwej miłości, czy zaręczyć się z królem i prowadzić dostatnie, ale pozbawione miłości życie. Ujawnione zostają fakty, za sprawą których Zła Królowa nienawidzi Śnieżki.

Pan Gold usiłuje odkryć prawdziwą tożsamość Augusta, a Emma stara się skonfrontować Reginę z faktem zniknięcia Kathryn. David próbuje przeprosić i pogodzić się z Mary Margaret. Tymczasem w dawnej krainie baśni Rumpelsztyk zgadza się podporządkować i zrobić, co w jego mocy, jeśli jego synowi uda się znaleźć sposób na to, by bezpiecznie pozbawić go mocy i przywrócić do dawnej postaci kochającego ojca, jakim kiedyś był.

August obiecuje oświecić Emmę i zabrać w podróż, która pokaże jej, jak może pokonać Reginę i możliwie przejąć opiekę nad Henrym. Po powrocie Mary Margaret do pracy, Regina wprowadza w życie swój plan uwiedzenia Davida. Tymczasem w dawnej krainie baśni, zanim dosięgła jej klątwa Złej Królowej, Gepetto zgadza się na wzięcie udziału w planie mającym na celu uratowanie córki Śnieżki i Księcia, ale pod warunkiem, że będzie mógł również uratować swojego syna.

Henry błaga Emmę, żeby pozostała w Storybrooke i kontynuowała walkę jako wybawicielka mieszkańców krainy baśni. Regina obmyśla plan, który pozwoli jej pozbyć się Emmy na zawsze. Tymczasem w dawnej krainie baśni Śnieżka wzywa na pomoc swoich sojuszników. Mają oni pomóc w ocaleniu Księcia i pokonaniu Złej Królowej.

Henry pada ofiarą zaklęcia przeznaczonego dla Emmy, wobec czego Regina i Emma łączą siły we wspólnym poszukiwaniu lekarstwa, które uratuje mu życie. Tymczasem w krainie baśni Książę stara się wyrwać ze szponów Złej Królowej. Aby ocalić Śnieżkę, dobija nawet targu z Rumpelsztykiem. Niestety, jest nieświadomy, że na pomoc jest już za późno…

Rzeczywistość stapia się z mitem, gdy baśniowe postaci wybudzają się z przełamanej klątwy Złej Królowej Reginy i pamiętają, kim były. Ale ku ich rozczarowaniu nie zostają przeniesione do baśniowej krainy. Co gorsza, Rumpelsztyk, czyli pan Gold, żeby zdobyć przewagę w swojej walce z Reginą, wprowadza do miasteczka magię. W baśniach magia ma swoje miejsce, ale w naszym świecie może mieć niepożądane konsekwencje. Tymczasem w Krainie Baśni książę Phillip budzi swoją śpiącą królewnę, Aurorę, ale odkrywa, że on i jego towarzyszka podróży, Mulan, wkrótce będą musieli stoczyć walkę na śmierć i życie.

Regina usiłuje odzyskać swoją magiczną moc. David poszukuje Mary Margaret i Emmy. Krasnoludki odkrywają, co się dzieje z ludźmi usiłującymi opuścić Storybrooke. W Zaczarowanym Lesie zbliża się dzień ślubu Reginy i króla Leopolda. Regina spotyka mężczyznę, który obiecuje jej pomoc w uwolnieniu się spod wpływu Cory.

Emma i Mary Margaret z pomocą Mulan, Aurory i Lancelota szukają drogi powrotnej do Storybrooke. Ich bezpieczeństwu zagrażają mroczne siły. Henry usiłuje przekonać Jeffersona do spotkania z Grace. W Zaczarowanym Lesie dzień przed spotkaniem z matką Księcia Śnieżka zostaje otruta przez króla Georgea. Klątwę może zdjąć z niej tylko woda z jeziora zamieszkałego przez Panią Jeziora.

Belle nie jest w stanie dłużej ukrywać obrzydzenia związanego z żądzą władzy pana Golda i grozi mu, że go opuści, o ile ten nie zmieni swego postępowania. Krasnale biorą w ręce swoje toporki i starają się odnaleźć baśniowy pył w kopalni Storybrooke. Spotkanie ze starym znajomym może się okazać zgubne dla Belle. Tymczasem w byłej Krainie Baśni Rumpelsztyk próbuje ratować swoją żonę Milah przed porwaniem przez gang okrutnych piratów.

Podczas gdy Regina nadal stara się powstrzymać przed używaniem swojej magii, żeby odzyskać uczucia Henry’ego, zaczyna widzieć coś, co wydaje jej się być duchem z przeszłości. Kiedy Mary Margaret i Emma odkrywają samotnego ocalałego z masakry ogrów, Emma zaczyna kwestionować, czy mówi on, czy nie całą prawdę. Tymczasem w byłej Krainie Baśni Regina odkrywa, że nie udaje jej się nauczyć czarnej magii od mistrza ciemności, ponieważ coś z jej przeszłości powstrzymuje ją od używania magii na poczet zła.

Mary Margaret i Emma mają nadzieję powrócić do Storybrooke przy pomocy magicznego kompasu, który należy do krwiożerczego olbrzyma. Emma wraz z niegodnym zaufania kapitanem Hakiem wyruszają na poszukiwanie kompasu.

W Storybrooke zostaje popełnione okrutne morderstwo. Główną podejrzaną o popełnienie tej krwawej zbrodni zostaje Ruby. W kopalni pod miastem Leroy znajduje skarb, który może pomóc Emmie i Mary Margaret.

Cora robi wszystko, co w jej mocy, żeby wykraść kompas Mary Margaret i Emmie, starając się znaleźć wejście do Storybrooke. Tymczasem, żeby uchronić Henry’ego przed dalszym niebezpieczeństwem, Regina i pan Gold muszą narazić życie Davida, usiłując skontaktować go z Mary Margaret, żeby podać jej istotne informacje, które mogą pomóc jej i Emmie w powrocie przez portal do Storybrooke.