Młody detektyw James Gordon, oddelegowany do zwalczania przestępczości i przywrócenia Gotham City dawnej świetności, zostaje przydzielony do sprawy morderstwa pewnej znanej pary. Obiecuje wówczas zdruzgotanemu po stracie rodziców nastoletniemu synowi, Bruce’owi Wayne’owi, że odnajdzie mordercę. To nie tylko obowiązek, ale i obsesja, która będzie go drogo kosztować, i wciągnie do mrocznego, ekscytującego świata Gotham.
Istnieje schronienie dla uchodźców z Gotham — dopóki Pingwin nie przybywa po swoich ludzi. Zdeterminowana Selina prosi Bruce’a o pomoc w szukaniu Jeremiaha.
Siły specjalnie przyjeżdżają do Gotham, aby zaprowadzić porządek. Poszukiwania odpowiedzi doprowadzają Nygmę do Pingwina — i do ponownego spotkania z Hugo Strange’em.
Gdy Gordon zbiera zespół, aby odbić Gotham, na wojnie o miasto zawiązują się niespodziewane sojusze. Przebiegły nowy złoczyńca narusza spokój Pingwina i Seliny.
Gordon walczy z czasem, starając się ujawnić kryminalistów, którzy zagrażają zjednoczeniu Gotham. Znajomy złoczyńca powraca z pomocą Szalonego Kapelusznika.
Bane i Nyssa umacniają swoje panowanie w mieście, a Gordon zwraca się do byłych wrogów o pomoc, aby je ocalić. Poważna decyzja zwraca Bruce’a ku jego przeznaczeniu.
Dziesięć lat po opuszczeniu Gotham Bruce powraca do miasta na otwarcie nowego wieżowca Wayne’a i odkrywa, że mroczne miasto potrzebuje swojego rycerza.