Filmy helikopter, lobotomia

Młoda kobieta zostaje zamknięta w zakładzie psychiatrycznym. Będąc tam, tworzy we własnej głowie alternatywną rzeczywistość.

Wydarzenia przedstawione w filmie, maja miejsce niedługo po części pierwszej. Tym razem dochodzi do znacznego pogorszenia stosunków, między ludźmi i mutantami. Pewna organizacja rządowa, dokonuje ataku na szkołę Xaviera. Porywają oni większości uczniów, z zamiarem uczynienia z nich broni przeciwko mutantom. Z ataku udaje się jednak uciec kilku członkom X-MEN, którzy łączą swoje siły z Magneto i atakują siedzibę organizacji.

Pewna kobieta budzi się w pokoju o wielkości 5 na 5 metrów, o metalowych ścianach. W każdej ścianie są drzwi przypominające właz w łodzi podwodnej. Sześcian łączy się z innymi, które są identyczne. Bohaterka z ulgą spotyka innych ludzi uwięzionych w pułapce, ale wpada w przerażenie, gdy okazuje się, że w kolejnych pokojach są ukryte śmiercionośne urządzenia. Garstka ludzi usiłuje przetrwać w labiryncie. Część akcji toczy się poza sześcianem, w obserwatorium, gdzie strażnicy monitorują wszystko, co dzieje się w tym niecodziennym więzieniu. Otrzymują rozkazy z góry, a gdy jeden z nich zaczyne stawiać niewygodne pytania, wkrótce sam znajduje się w klatce o stalowych ścianach.