Yoshiyama Mihane to uczennica trzeciej klasy liceum. Jest członkinią klubu fotograficznego. Pewnego dnia, czując zapach lawendy, dociera do szkolnego laboratorium, gdzie traci przytomność. Od tego momentu dziewczyna zyskuje zdolność przeskakiwania w czasie, o czym nie mówi nikomu. Sytuacja komplikuje się, gdy jej przyjaciel, Fukamachi Shohei, wyznaje dziewczynie swoje uczucia.
W niedalekiej przyszłości tajemnicza plaga zabiła większość ludzkości. Dwoje ocalałych przemierza bezdroża, szukając lekarstwa na wirusa, oraz tego co pozwoliło by im przeżyć kolejny dzień. Nieoczekiwanie spotykają człowieka, który jak twierdzi może wszystko odmienić, dzięki urządzeniu do podróży w czasie.
W przyszłości powierzchnia Ziemi, została zanieczyszczona do tego stopnia, że nieliczni ocaleli zostali zmuszeni, do zamieszkania w mieście ponad chmurami. Nie jest to bynajmniej utopia, gdyż rządzące nim maszyny i korporacje zmuszają większość ludzi do nędznej egzystencji. Wszytko zmienia się, gdy doktor Kisaragi tworzy androida mogącego uzdrowić planetę. Nim to jednak nastąpi Cutie Honey będzie musiała zmierzyć się z bezwzględnymi maszynami.
Stworzony przez obcych cyborg wymyka się spod kontroli i przybywa na Ziemię, zmieniając ludzi w podobne sobie maszyny zniszczenia. Przez przypadek w plany Sheborg wmieszane zostają dwie anarchistki Dylan i Eddie, które wraz z grupką śmiałków muszą powstrzymać cyborgi nim przemienią mieszkańców miasteczka.
Po tym, jak Tian Xiao Jun zostaje rzucona przez swojego narzeczonego, postanawia się upić. Wracając z baru, kupuje w sklepie spożywczym HE-CAN, myśląc, że to nowa marka piwa. Wpadając na łobuzów, puszka wypada jej z ręki, a ze środka wypada... mężczyzna!
Sześcioro dzieci będących efektem genetycznych eksperymentów ucieka z tajnego laboratorium, ukrywając się odtąd w odizolowanym domku w górach. Niestety ich twórcy, w końcu namierzają kryjówkę i wysyłają za nimi w pogoń Likwidatorów - pół ludzi, pół wilków. Gdy najmłodsza z nich zostaje porwana a dom zniszczony, nie pozostaje im nic innego jak wrócić do miejsca swoich narodzin i wyrównać rachunki.
Skuszony ogromną sumą złota łowca nagród Dresher, zgadza się ruszyć pościg za poszukiwanym bandytą. Typowe zadanie wkrótce przemienia się w coś zupełnie innego gdy Dresher spotyka na swojej drodze tajemniczego Finisher'a, który uświadamia mu, że świat jaki zna jest tylko jednym z wielu.