Castle i Beckett badają sprawę zabójstwa druhny. Castle nie ukrywa zaskoczenia, kiedy dowiaduje się, kim jest panna młoda. Emocje utrudniają mu wykonywanie swojej pracy.

W ramach śledztwa w sprawie śmierci irlandzkiego gangstera Beckett i Castle dowiadują się o miejscowej wojnie terytorialnej, która może być powiązana zarówno z guru informacyjnej reklamy, jak i międzynarodową siatką przemytu narkotyków. Sprawa robi się boleśnie osobista, gdy pojawiają się dowody na to, że ścigany przez nich morderca mógł maczać palce w zabójstwie matki Beckett.

Powracająca z wakacji rodzina odkrywa w łóżku ich córki martwego mężczyznę. Śledztwo, które początkowo wydaje się dotyczyć zabójstwa dzikiego lokatora, wkrótce ujawnia, że w grę wchodzi wielomilionowy napad z bronią w ręku. Tymczasem Castle stara się nie dopuścić, aby Beckett dowiedziała się, że w publikacji, która umieściła go na liście dziesięciu najbardziej pożądanych kawalerów w Nowym Jorku, nadmieniono, iż są parą.

Uwielbiany przez wszystkich były zawodnik zawodowej ligi baseballowej zostaje znaleziony martwy po odbyciu podróży na Kubę. Podczas śledztwa detektywi wpadają na menadżera Joego Torre oraz poznają kubańską społeczność Nowego Jorku. Tymczasem genealogiczny projekt Alexis zmusza Castle’a do zastanowienia się nad tożsamością jego nieznanego ojca.

W publicznym parku znalezione zostaje oblane sosem karmelowym ciało półnagiej kobiety. W ramach śledztwa Castle i Beckett muszą zbadać nowojorskie środowisko osób uprawiających seksualną dominację, co dla tych dwojga stanowi pretekst do uszczypliwej wymiany zdań.

Wnikliwa i doświadczona agentka federalna Jordan Shaw nawiązuje współpracę z Castle'em oraz Beckett w celu złapania przebiegłego i nieuchwytnego seryjnego zabójcy, który ma słabość do bohaterki nowej książki Richarda, Nikki Heat. Oznacza to, że Kate może stanowić ostateczny cel mordercy.

Seryjny zabójca nadal pozostaje na wolności, bawiąc się z Castle'em, Beckett i Jordan Shaw w kotka i myszkę. Po przeżyciu wybuchu, który kompletnie niszczy jej mieszkanie, Kate wycofuje się ze sprawy. Jednak gdy zabójca porywa agentkę Shaw, chcąc dotrzeć tym samym do Beckett, ta przejmuje dochodzenie i postanawia zdać się na pisarski instynkt Castle’a, by uratować siebie i koleżankę z FBI.

Śledztwo w sprawie szokującej śmierci muzealnego kuratora, który został zmiażdżony przez spadającą rzeźbę gargulca, przyjmuje dziwaczny obrót, gdy Castle i Beckett dowiadują się, że nie jest on pierwszym członkiem niedawnej wyprawy archeologicznej, jakiemu przyszło umrzeć w podejrzanych okolicznościach. Okazuje się, że na wejściu do komory grobowej, ekipa odkryła ostrzeżenie mówiące, że „każdy, kto spojrzy na twarz faraona będzie przeklęty”. Czy kurator stał się ostatnią ofiarą starożytnej klątwy? A jeśli tak, co to oznacza dla Castle’a, który przyjrzał się mumii, gdy nikt nie patrzył.

Castle pojawia się w wieczornym, telewizyjnym talk show, by promować swoją nową książkę. Podczas przerwy na reklamę legendarny gospodarz programu, Bobby Mann, pochyla się w stronę swojego gościa i szepcze mu do ucha, że „chcą go zabić”. Gdy prezenter umiera jeszcze tego samego wieczoru z – wydawałoby się – przyczyn naturalnych, Castle musi przekonać Beckett, że doszło do przestępstwa. W trakcie śledztwa Richard ulega czarowi hollywoodzkiej seksbomby, która była drugim gościem w ostatnim talk show Bobby’ego.

W trakcie przeprowadzania dochodzenia odnośnie zabójstwa pewnego złodzieja Castle i Beckett z zaskoczeniem odkrywają, że Esposito ma osobiste powiązania z głównym podejrzanym. Inna niespodzianka czeka Richarda, gdy okazuje się, że Kate znajduje świetne porozumienie z Tomem Demmingiem, detektywem przydzielonym do sprawy z innego wydziału.

Beckett i Castle badają okoliczności śmierci słynnego szefa kuchni, którego zamrożone ciało odkryto na zapleczu modnej, nowojorskiej restauracji. Sprawy się dalej komplikują, gdy Richard zaczyna spotykać się z Madison Queller, pracodawczynią ofiary i szkolną koleżanką Kate. Tymczasem związek Beckett z detektywem Demmingiem nadal się rozwija.

Sprawa napadu powiązanego z zabójstwem skłania Beckett do zwrócenia się o pomoc do detektywa Demminga, dzięki czemu Castle może z bliska przyglądać się ich rozkwitającemu romansowi. Gdy okazuje się, że obaj panowie mają całkiem odmienne zdanie w kwestii tego, w jaki sposób poprowadzić sprawę, dochodzenie staje się cichą rywalizacją o uwagę Kate.

Castle i Beckett prowadzą śledztwo w sprawie zabójstwa pracownika agencji wywiadowczej, który miał powiązania z symulowaną grą szpiegowską. Tymczasem romans Kate z detektywem Demmingiem zagraża jej relacji z Castle'em, zmuszając oboje do skonfrontowania swoich uczuć.

Gdy rozpoczyna się nowy sezon serialu Castle, Beckett nie wie, co się dzieje z Castle'em, odkąd wyjechał do Hamptons kilka miesięcy temu, aby ukończyć pisanie swojej drugiej powieści „Nikki Heat” pt. „Naked Heat”. Jedyne, co Beckett, Ryan i Esposito wiedzieli ostatnio na temat Castle'a, to banner w księgarni reklamujący jego spotkanie z czytelnikami w celu podpisywania swojej najnowszej książki. Gdy zatem Beckett i jej ekipa trafiają do ciemnego mieszkania w sprawie przeprowadzenia śledztwa dot. morderstwa, ostatnią rzeczą, jakiej oczekują jest spotkanie Castle'a stojącego nad zwłokami kobiety i trzymającego broń! Podczas gdy Castle twierdzi, że jest niewinny, Beckett nie pozostaje nic innego jak zatrzymać go jako podejrzanego morderstwa.

Kiedy słynna kobieta-medium zostaje zamordowana, Beckett i Castle szukają jej zabójcy, prowadząc jednocześnie duchową debatę na temat istnienia zdolności nadprzyrodzonych. Dowody piętrzą się po obydwu stronach, szczególnie gdy dociera do nich list od ofiary, napisany w dniu jej zabójstwa, w którym przewidziała ona swoją własną śmierć – czy może został on napisany przez sprytnego zabójcę, mającego nadzieję, że to zakończy śledztwo?

Gdy kodowany dokument ukryty przez zamordowanego poręczyciela majątkowego pobudza wyobraźnię Castle’a, Beckett musi sterować sprawą tak, aby trafić z powrotem do okrutnych zbrodniarzy, którzy zamieszkiwali świat ofiary, by odkryć, że może szalone teorie Castle’a nie są aż tak szalone. Sprawy komplikuje pojawienie się byłego partnera Beckett (aktualnie łowcy nagród). Podczas gdy ci dwoje wracają do siebie, Castle nie mając w tym udziału, może tylko obserwować, jak ich relacja się romantycznie rozwija.

Castle i Beckett zajmują się morderstwem młodego matematyka zastrzelonego 200-letnią kulą. Castle tworzy dziwne teorie o zabójcy podróżującym w czasie. Gdy poprzez śledztwo odkrywają podejrzanego w wiktoriańskim stroju, szalony pomysł Castle’a wydaje się mieć pewne uzasadnienie. Powiązane elementy zagadki przeprowadzają ich przez wieże na Wall Street do świata ludzi z ery parowej odzwierciedlających romantyczność i prostotę przeszłości, w połączeniu z nadzieją i obietnicą przyszłości.

Pojawia się tajemnica, gdy podczas pogrzebu niosący dziwnie ciężką trumnę mężczyźni tracą nad nią kontrolę, obok nieboszczyka pojawia się drugie ciało – kobiety. Kiedy Castle i Beckett dowiadują się, że ofiarą była lekarka z lokalnego szpitala, śledztwo doprowadza ich w głąb świata kochliwych wskakujących sobie do łóżek lekarzy. Czy to zazdrość spowodowała morderstwo? Czy tajemnicza praca lekarki poza szpitalem doprowadziła do jej zgonu? W międzyczasie związek Castle z Giną jest poddany próbie, gdy ta nawiązuje bliższe więzi z Alex.

Gdy piękna kobieta zostaje znaleziona martwa w alejce, wszystko wskazuje na to, że jest ona ofiarą notorycznego potrójnego mordercy. Tak zwany Potrójny Morderca, lub 3XK, terroryzował Nowy Jork cztery lata temu, a następnie tajemniczo zniknął. Teraz jest z powrotem. Walcząc z czasem, Castle i Beckett starają się zatrzymać 3XK, zanim dopadnie kolejną ofiarę.

Odpowiadając na nagłe wezwanie, ostatnia sprawa Castle’a i Beckett przybiera niespodziewany obrót, gdy odkrywają, że ofiarą nie jest policjant, a striptizer ubrany jak funkcjonariusz. Morderstwo prowadzi do świata klubów z męskimi striptizerami, ciężkim życiem bezrobotnych aktorów i ceną, jaką ludzie płacą, aby osiągnąć sławę. Czy ofiara morderstwa przewidziała, że jej sny o gwiazdach doprowadzą do jej zabójstwa, czy doprowadziło do tego coś bardziej nikczemnego?

Podczas śledztwa dotyczącego morderstwa pracownika nowojorskiego metra zastrzelonego w Central Parku Castle i Beckett niespodziewanie odkrywają szokujące uprowadzenie młodego chłopca. Pracując bez przerwy, ekipa musi odkryć motywy stojące za porwaniami, nie tylko odkryć mordercę, ale także ochronić życie niewinnych osób.

Po tym, jak ciało prominentnej astrofizyczki zostaje znalezione w jej samochodzie – padła ofiarą wybuchowej dekompresji – Castle żartuje, że może została zabita w odkurzaczu z przestrzeni kosmicznej. Gdy zagłębiają się w życie ofiary, zostają skonfrontowani z dowodami, prowadzącymi ich do niemożliwego – uprowadzenia przez obcych.

Śledztwo w sprawie śmierci byłego dokera, który został właścicielem baru, prowadzi Beckett i Castle’a do podziemnych tuneli miasta, gdzie odkrywają tajemnicę z czasów prohibicji. Dochodzenie skupia się na historii nowojorskich barów, co staje się inspiracją dla Castle’a do otworzenia własnego.