Sean Anderson (Josh Hutcherson) towarzyszy chłopakowi swojej matki (Dwayne Johnson) w misji, podczas której mają znaleźć jego dziadka, który rzekomo zaginął na mitycznej wyspie. Film na podstawie dzieła Julesa Verne'a "The Mysterious Island".
Dr Jerimiah Morley będąc przeświadczony o tym, że świat ogarnie wojna atomowa, organizuje ekspedycję w głąb ziemi, by odszukać jaskinię zdatną do zamieszkania. Stworzywszy pojazd zdolny wytrzymać trudy podróży Morley, wraz z kilkoma innymi naukowcami, wyrusza w podróż swojego życia. Pomimo licznych niedogodności i śmierci kilku członków wyprawy, udaje im się natrafić na idealne schronienie.
Grupa archeologów wraz z wynajętymi robotnikami odkopuję w pobliżu Stonehenge szczątki człowieka oraz tajemnicze urządzenie ukryte pod podłożem starożytnego monumentu. Nie zdając sobie sprawy z możliwości nowo odkrytego artefaktu uruchamiają je, a tym samym zapoczątkowują łańcuch wydarzeń który może doprowadzić do końca cywilizacji jaką znamy dziś.
Wokół jeziora, będącego jedynym źródłem wody w promieniu wielu mil żyją dwa plemiona. Żądny władzy generał jednego z ich atakuje swoich sąsiadów, by przejąć kontrolę nad akwenem. Gdy zostaje za to skazany na sąd kapłanów zabija króla i przejmuje władzę w państwie. Kres jego okrutnym rządom próbuje położyć przywódca podbitego plemienia Ursus, ale nie będzie to wcale proste.
Na jednej z tropikalnych wysepek pojawia się prehistoryczny krokodyl. Olbrzymia bestia jak się szybko okazuje gustuje w ludzkim mięsie, a ofiar ma w okolicy pod dostatkiem. Wkrótce wpada na trop grupy geologów i teksańskiego łowcy krokodyli.
Erupcje wulkaniczne budzą uśpionego przez wieki potwora nazwanego Gyaosu. Wrażliwe na światło monstrum zaczyna opuszczać swoje leże każdej nocy, szukać pożywienia i niszczyć wszystko na swojej drodze. Powstrzymać go próbują naukowcy i wojsko, ale – jak zwykle – tylko Gamera może ocalić Japonię i powiązanego z nią telepatycznie chłopca – Eiichiego.
W systemie słonecznym pojawia się podobna do Ziemi planeta. Od tej chwili rozpoczyna się wyścig, który z krajów wyśle tam pierwszą, załogową ekspedycję. Udaje się to oczywiście Amerykanom, którzy po latach przygotowań wysyłają tam czwórkę naukowców. Ci odkrywają, że planeta jest zdatna do życia, ale zamieszkują ją prehistoryczne stworzenia.